Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF3P20783 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NTF3P20783 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTF3P20783 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTF3P20783 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms