Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB5AP20339 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms