Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms