Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATF3P18847 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATF3P18847 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATF3P18847 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATF3P18847 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATF3P18847 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATF3P18847 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF3P18847 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF3P18847 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF3P18847 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATF3P18847 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms