Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR1P18146 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR1P18146 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR1P18146 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR1P18146 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR1P18146 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR1P18146 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR1P18146 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR1P18146 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR1P18146 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR1P18146 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms