Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF4P18085 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF4P18085 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF4P18085 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARF4P18085 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF4P18085 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF4P18085 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms