Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCP1P17987 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCP1P17987 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCP1P17987 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TCP1P17987 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCP1P17987 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCP1P17987 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCP1P17987 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms