Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA1P17302 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA1P17302 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GJA1P17302 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA1P17302 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA1P17302 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA1P17302 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA1P17302 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA1P17302 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA1P17302 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA1P17302 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA1P17302 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA1P17302 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA1P17302 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA1P17302 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA1P17302 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA1P17302 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms