Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms