Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDGFRAP16234 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDGFRAP16234 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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