Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ITGB4P16144 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB4P16144 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms