Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2RAP15509 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2RAP15509 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF2RAP15509 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms