Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNT1P13805 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms