Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRG2P13727 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRG2P13727 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRG2P13727 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRG2P13727 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRG2P13727 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRG2P13727 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRG2P13727 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRG2P13727 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRG2P13727 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRG2P13727 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRG2P13727 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRG2P13727 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRG2P13727 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRG2P13727 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRG2P13727 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRG2P13727 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRG2P13727 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRG2P13727 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRG2P13727 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRG2P13727 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRG2P13727 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRG2P13727 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRG2P13727 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRG2P13727 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRG2P13727 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms