Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC1P11047 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC1P11047 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms