Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL3P10147 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL3P10147 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL3P10147 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCL3P10147 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL3P10147 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms