Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms