Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC175P0C221 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms