Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFNA4P05014 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFNA4P05014 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms