Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC1P02654 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC1P02654 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC1P02654 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC1P02654 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC1P02654 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC1P02654 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC1P02654 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC1P02654 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC1P02654 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms