Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOEP02649 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOEP02649 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOEP02649 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOEP02649 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOEP02649 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOEP02649 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOEP02649 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOEP02649 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOEP02649 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOEP02649 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOEP02649 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOEP02649 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOEP02649 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOEP02649 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOEP02649 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOEP02649 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOEP02649 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOEP02649 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOEP02649 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOEP02649 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOEP02649 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms