Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTA1P02549 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms