Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOMM40O96008 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms