Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE8BO95263 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE8BO95263 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms