Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIF4AO95239 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF4AO95239 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms