Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSTN1O94985 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms