Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3JO75822 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms