Protein–RNA interactions for Protein: O75570

MTRF1, Peptide chain release factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1O75570 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTRF1O75570 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTRF1O75570 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms