Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE8AO60658 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE8AO60658 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms