Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZIC3O60481 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC3O60481 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms