Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXTL3O43909 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL3O43909 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms