Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRNO43815 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRNO43815 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRNO43815 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRNO43815 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRNO43815 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRNO43815 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRNO43815 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRNO43815 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRNO43815 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRNO43815 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
STRNO43815 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRNO43815 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRNO43815 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms