Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFA2T2O43439 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms