Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MSI1O43347 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSI1O43347 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSI1O43347 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSI1O43347 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSI1O43347 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSI1O43347 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MSI1O43347 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MSI1O43347 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MSI1O43347 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI1O43347 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI1O43347 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI1O43347 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI1O43347 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI1O43347 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI1O43347 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI1O43347 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI1O43347 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MSI1O43347 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MSI1O43347 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms