Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PER1O15534 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PER1O15534 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PER1O15534 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER1O15534 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PER1O15534 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PER1O15534 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PER1O15534 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PER1O15534 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PER1O15534 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PER1O15534 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PER1O15534 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms