Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms