Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CEP290O15078 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CEP290O15078 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP290O15078 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP290O15078 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP290O15078 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP290O15078 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP290O15078 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP290O15078 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP290O15078 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP290O15078 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP290O15078 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP290O15078 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP290O15078 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP290O15078 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP290O15078 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP290O15078 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP290O15078 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP290O15078 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP290O15078 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP290O15078 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP290O15078 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP290O15078 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP290O15078 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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