Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
SYNJ2O15056 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNJ2O15056 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms