Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3EO15041 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms