Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR3AO14802 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR3AO14802 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms