Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms