Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLRMTO00411 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLRMTO00411 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLRMTO00411 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLRMTO00411 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLRMTO00411 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLRMTO00411 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLRMTO00411 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLRMTO00411 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLRMTO00411 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLRMTO00411 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms