Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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