Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DEV8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DEV8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B4DEV8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B4DEV8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DEV8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DEV8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DEV8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
B4DEV8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms