Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms