Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC169A6NNP5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms