Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDYE4A6NLX3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms