Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBY3A6NI87 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms