Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms