Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L4A6NCW7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms